Protein–RNA interactions for Protein: O14730

RIOK3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK3O14730 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIOK3O14730 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms