Protein–RNA interactions for Protein: M0QZC1

RNF225, RING finger protein 225, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF225M0QZC1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF225M0QZC1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF225M0QZC1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms