Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3QKU1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3QKU1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3QKU1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3QKU1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3QKU1 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3QKU1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3QKU1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
J3QKU1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
J3QKU1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3QKU1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3QKU1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3QKU1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3QKU1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3QKU1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
J3QKU1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QKU1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QKU1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QKU1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QKU1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QKU1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QKU1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QKU1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QKU1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QKU1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QKU1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QKU1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QKU1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QKU1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QKU1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QKU1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QKU1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QKU1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QKU1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
J3QKU1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QKU1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QKU1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QKU1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QKU1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QKU1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QKU1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QKU1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QKU1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QKU1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QKU1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QKU1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QKU1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QKU1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QKU1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QKU1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QKU1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QKU1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QKU1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QKU1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QKU1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
J3QKU1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QKU1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QKU1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QKU1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QKU1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QKU1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QKU1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QKU1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QKU1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QKU1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QKU1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QKU1 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QKU1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QKU1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QKU1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QKU1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QKU1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QKU1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QKU1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
J3QKU1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
J3QKU1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
J3QKU1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
J3QKU1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
J3QKU1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QKU1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QKU1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QKU1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QKU1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QKU1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QKU1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QKU1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QKU1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QKU1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QKU1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QKU1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QKU1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
J3QKU1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QKU1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QKU1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QKU1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QKU1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QKU1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QKU1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QKU1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
J3QKU1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms