Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00587B1AMM8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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