Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC69A6NI79 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC69A6NI79 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms