Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GOLGA6CA6NDK9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms