Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS37CA5D8V6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VPS37CA5D8V6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms