Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRD1A4D1F6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRD1A4D1F6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms