Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQJ8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQJ8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
A0A0U1RQJ8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
A0A0U1RQJ8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms