Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 FTH1-209ENST00000533138 885 ntTSL 512.17□□□□□ -0.469e-7■■■■□ 24.4
UTP3Q9NQZ2 FTH1-204ENST00000529548 567 ntTSL 310.85□□□□□ -0.679e-7■■■■□ 24.4
UTP3Q9NQZ2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.084e-7■■■■□ 24.4
UTP3Q9NQZ2 RPL13-208ENST00000487034 615 ntTSL 1 (best)23.75■■□□□ 1.392e-6■■■■□ 24.3
UTP3Q9NQZ2 ARID3A-207ENST00000592216 564 ntTSL 212.74□□□□□ -0.378e-7■■■■□ 24.3
UTP3Q9NQZ2 LMNA-214ENST00000478063 285 ntTSL 514.38□□□□□ -0.114e-8■■■■□ 24.3
UTP3Q9NQZ2 LMNA-224ENST00000515711 569 ntTSL 512.79□□□□□ -0.364e-8■■■■□ 24.3
UTP3Q9NQZ2 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.118e-6■■■■□ 24.3
UTP3Q9NQZ2 CCT3-206ENST00000368262 2048 ntTSL 214.8□□□□□ -0.048e-6■■■■□ 24.3
UTP3Q9NQZ2 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.188e-6■■■■□ 24.3
UTP3Q9NQZ2 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.218e-6■■■■□ 24.3
UTP3Q9NQZ2 CCT3-203ENST00000368258 1885 ntTSL 212.75□□□□□ -0.378e-6■■■■□ 24.3
UTP3Q9NQZ2 HSPA8-218ENST00000532636 2306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.611e-7■■■■□ 24.2
UTP3Q9NQZ2 SEC13-216ENST00000479868 2374 ntTSL 1 (best)14.11□□□□□ -0.153e-6■■■■□ 24.2
UTP3Q9NQZ2 TRMT2A-211ENST00000468917 957 ntTSL 220.77■□□□□ 0.923e-6■■■■□ 24.2
UTP3Q9NQZ2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.258e-7■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.238e-7■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 NARF-216ENST00000581202 1013 ntTSL 521.13■□□□□ 0.978e-7■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.748e-7■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 NARF-203ENST00000374611 1722 ntTSL 518.01■□□□□ 0.478e-7■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.448e-7■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 NARF-218ENST00000581795 1430 ntTSL 217.52■□□□□ 0.48e-7■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 NARF-208ENST00000577432 866 ntTSL 517.32■□□□□ 0.368e-7■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 NARF-220ENST00000582907 1454 ntTSL 515.03■□□□□ -08e-7■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 NARF-201ENST00000309794 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.28e-7■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 NARF-209ENST00000577812 2598 ntTSL 512.45□□□□□ -0.428e-7■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 DDB1-205ENST00000535174 896 ntTSL 318.06■□□□□ 0.482e-6■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 CAPZA1-201ENST00000263168 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.582e-6■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 DDB1-225ENST00000545930 1278 ntTSL 210.34□□□□□ -0.752e-6■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 CAPZA1-206ENST00000498626 650 ntTSL 58.04□□□□□ -1.122e-6■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 CAPZA1-204ENST00000476936 867 ntTSL 37.12□□□□□ -1.272e-6■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 VAPA-209ENST00000585042 567 ntTSL 415.86■□□□□ 0.132e-7■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 FAR1-201ENST00000354817 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.494e-6■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 ZNF692-212ENST00000478107 1051 ntTSL 521.87■■□□□ 1.092e-6■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 NOP56-220ENST00000616692 2662 ntTSL 1 (best)18.33■□□□□ 0.533e-8■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 NOP56-219ENST00000612233 2980 nt15.27■□□□□ 0.033e-8■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 NOP56-202ENST00000415272 1628 ntTSL 510□□□□□ -0.813e-8■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 NOP56-207ENST00000467196 1320 ntTSL 59.03□□□□□ -0.963e-8■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.241e-6■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.21e-6■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 HNRNPR-201ENST00000302271 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.311e-6■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 HNRNPR-203ENST00000374616 2691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.331e-6■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 HNRNPR-202ENST00000374612 2694 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.351e-6■■■■□ 24.1
UTP3Q9NQZ2 METTL26-206ENST00000448973 1710 ntTSL 1 (best)25.55■■□□□ 1.683e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 SDHA-202ENST00000502379 679 ntTSL 223.54■■□□□ 1.363e-13■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 METTL26-210ENST00000565799 716 ntTSL 323.53■■□□□ 1.363e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 SDHA-212ENST00000509632 583 ntTSL 423.01■■□□□ 1.273e-13■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.133e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.083e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 GAR1-204ENST00000506840 831 ntTSL 221.17■□□□□ 0.983e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 METTL26-209ENST00000565163 485 ntTSL 320.42■□□□□ 0.863e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 METTL26-211ENST00000568077 588 ntTSL 319.53■□□□□ 0.723e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 METTL26-213ENST00000568830 590 ntTSL 319.53■□□□□ 0.723e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.662e-6■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 METTL26-212ENST00000568773 499 ntTSL 218.72■□□□□ 0.593e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 METTL26-207ENST00000456420 755 ntTSL 318.41■□□□□ 0.543e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 FDPS-212ENST00000487002 2017 ntTSL 218.17■□□□□ 0.53e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.493e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.493e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 METTL26-208ENST00000564039 518 ntTSL 218.02■□□□□ 0.483e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.473e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.423e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.373e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.263e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.223e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 ANXA2-223ENST00000559647 484 ntTSL 29.75□□□□□ -0.853e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 ADAM9-202ENST00000463437 583 ntTSL 26.52□□□□□ -1.373e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 TARS-203ENST00000502508 552 ntTSL 515.98■□□□□ 0.156e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.883e-6■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 ALDOC-209ENST00000584086 686 ntTSL 315.06■□□□□ 01e-6■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 ALDOC-205ENST00000460201 922 ntTSL 215.02■□□□□ -01e-6■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 ALDOC-207ENST00000581807 580 ntTSL 312.64□□□□□ -0.391e-6■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 ALDOC-204ENST00000435638 579 ntTSL 310.66□□□□□ -0.71e-6■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 UBA1-206ENST00000442035 1054 ntTSL 522.44■■□□□ 1.182e-6■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 UBA1-204ENST00000412206 1148 ntTSL 515.33■□□□□ 0.042e-6■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 UBA1-205ENST00000427561 671 ntTSL 514.45□□□□□ -0.12e-6■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.873e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.553e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 LSM7-202ENST00000585395 621 ntTSL 324.57■■□□□ 1.523e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.523e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 SEPT5-213ENST00000477238 577 ntTSL 418.5■□□□□ 0.553e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 MIIP-205ENST00000478749 779 ntTSL 216.42■□□□□ 0.223e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.23e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 EMD-209ENST00000494443 765 ntTSL 214.92□□□□□ -0.023e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 LSM7-207ENST00000591745 543 ntTSL 214.67□□□□□ -0.063e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 SEPT5-202ENST00000395109 794 ntTSL 213.85□□□□□ -0.193e-9■■■■□ 24
UTP3Q9NQZ2 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.093e-20■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 GAS5-222ENST00000451607 1007 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.493e-20■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 GAS5-224ENST00000454068 688 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.733e-20■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 GAS5-203ENST00000416952 799 ntTSL 210.27□□□□□ -0.773e-20■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 GAS5-214ENST00000436656 822 ntTSL 310.08□□□□□ -0.83e-20■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 GAS5-216ENST00000443799 897 ntTSL 510.08□□□□□ -0.83e-20■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 GAS5-210ENST00000431268 1698 ntTSL 29.45□□□□□ -0.93e-20■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.023e-20■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 GAS5-220ENST00000449589 712 ntTSL 38.68□□□□□ -1.023e-20■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 GAS5-226ENST00000455838 632 ntTSL 28.68□□□□□ -1.023e-20■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 GAS5-227ENST00000456293 583 ntTSL 37.67□□□□□ -1.183e-20■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.23e-20■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 GAS5-204ENST00000421068 1060 ntTSL 27.49□□□□□ -1.213e-20■■■■□ 23.9
UTP3Q9NQZ2 GAS5-228ENST00000456812 723 ntTSL 37.48□□□□□ -1.213e-20■■■■□ 23.9
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 3449.3 ms