Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARFGEF1Q9Y6D6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARFGEF1Q9Y6D6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms