Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP15Q9Y4E8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms