Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NFE2L3Q9Y4A8 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NFE2L3Q9Y4A8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms