Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
REXO2Q9Y3B8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
REXO2Q9Y3B8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms