Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SBNO2Q9Y2G9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SBNO2Q9Y2G9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms