Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SORCS3Q9UPU3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SORCS3Q9UPU3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms