Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH7Q9ULB5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms