Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSPAN16Q9UKR8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms