Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV9

DDX41, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX41, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX41Q9UJV9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX41Q9UJV9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX41Q9UJV9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX41Q9UJV9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX41Q9UJV9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX41Q9UJV9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX41Q9UJV9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX41Q9UJV9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX41Q9UJV9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX41Q9UJV9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX41Q9UJV9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX41Q9UJV9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX41Q9UJV9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX41Q9UJV9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX41Q9UJV9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX41Q9UJV9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX41Q9UJV9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX41Q9UJV9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DDX41Q9UJV9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX41Q9UJV9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX41Q9UJV9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DDX41Q9UJV9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms