Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OPN4Q9UHM6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms