Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DDX20Q9UHI6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms