Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NKX1-2Q9UD57 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NKX1-2Q9UD57 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms