Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DBF4Q9UBU7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DBF4Q9UBU7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DBF4Q9UBU7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DBF4Q9UBU7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DBF4Q9UBU7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DBF4Q9UBU7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DBF4Q9UBU7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DBF4Q9UBU7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DBF4Q9UBU7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DBF4Q9UBU7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DBF4Q9UBU7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DBF4Q9UBU7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DBF4Q9UBU7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DBF4Q9UBU7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DBF4Q9UBU7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
DBF4Q9UBU7 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DBF4Q9UBU7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DBF4Q9UBU7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DBF4Q9UBU7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DBF4Q9UBU7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DBF4Q9UBU7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DBF4Q9UBU7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DBF4Q9UBU7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DBF4Q9UBU7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DBF4Q9UBU7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DBF4Q9UBU7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
DBF4Q9UBU7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
DBF4Q9UBU7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms