Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms