Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RTEL1Q9NZ71 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTEL1Q9NZ71 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms