Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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