Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJC17Q9NVM6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms