Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTNNBIP1Q9NSA3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNBIP1Q9NSA3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms