Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CBX8Q9HC52 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms