Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP29Q9HBJ7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
USP29Q9HBJ7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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