Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHARPINQ9H0F6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHARPINQ9H0F6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms