Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NIF3L1Q9GZT8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NIF3L1Q9GZT8 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms