Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLIRPQ9GZT3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms