Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ROPN1BQ9BZX4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms