Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GTPBP4Q9BZE4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GTPBP4Q9BZE4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms