Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PACSIN1Q9BY11 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PACSIN1Q9BY11 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms