Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSPO3Q9BXY4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSPO3Q9BXY4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSPO3Q9BXY4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSPO3Q9BXY4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSPO3Q9BXY4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSPO3Q9BXY4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSPO3Q9BXY4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSPO3Q9BXY4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSPO3Q9BXY4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSPO3Q9BXY4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSPO3Q9BXY4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSPO3Q9BXY4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSPO3Q9BXY4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RSPO3Q9BXY4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RSPO3Q9BXY4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RSPO3Q9BXY4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RSPO3Q9BXY4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RSPO3Q9BXY4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms