Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SNHG12Q9BXW3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNHG12Q9BXW3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms