Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BRIP1Q9BX63 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRIP1Q9BX63 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms