Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PBDC1Q9BVG4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms