Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC32Q9BV29 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms