Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
C1orf50Q9BV19 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
C1orf50Q9BV19 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms