Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SEC22CQ9BRL7 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms