Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
MESP1Q9BRJ9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MESP1Q9BRJ9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms