Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
USB1Q9BQ65 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
USB1Q9BQ65 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms