Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ04

RBM4B, RNA-binding protein 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM4BQ9BQ04 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBM4BQ9BQ04 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBM4BQ9BQ04 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBM4BQ9BQ04 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBM4BQ9BQ04 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RBM4BQ9BQ04 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RBM4BQ9BQ04 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RBM4BQ9BQ04 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RBM4BQ9BQ04 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RBM4BQ9BQ04 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms