Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DUSP9Q99956 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DUSP9Q99956 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms