Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RBBP8Q99708 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms