Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NAP1L3Q99457 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NAP1L3Q99457 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms