Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRNT1Q96Q11 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRNT1Q96Q11 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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